Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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ALX1Q15699 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
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ALX1Q15699 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALX1Q15699 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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ALX1Q15699 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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ALX1Q15699 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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ALX1Q15699 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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ALX1Q15699 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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