Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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