Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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RAB39AQ14964 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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