Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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