Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms