Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXOSC2Q13868 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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