Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PKP1Q13835 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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PKP1Q13835 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PKP1Q13835 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PKP1Q13835 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PKP1Q13835 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PKP1Q13835 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PKP1Q13835 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PKP1Q13835 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PKP1Q13835 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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