Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA5AQ13591 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms