Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PKD2Q13563 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2Q13563 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
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