Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCIRG1Q13488 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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