Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCLQ13371 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDCLQ13371 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
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