Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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