Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSPB3Q12988 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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