Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms