Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TOMM6-201ENST00000398881 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.041e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.351e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 SMARCB1-208ENST00000634926 269 ntTSL 1 (best)2.19□□□□□ -2.061e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 SMARCB1-209ENST00000635578 242 ntTSL 1 (best)1.12□□□□□ -2.231e-9■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 AARS-202ENST00000564359 590 ntTSL 310.16□□□□□ -0.781e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 AARS-206ENST00000569790 528 ntTSL 57.18□□□□□ -1.261e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 LINC01029-203ENST00000582805 788 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.076e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.186e-8■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 520.1■□□□□ 0.815e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.045e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.345e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.445e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.455e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.595e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.645e-6■■□□□ 11.4
ILF3Q12906 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.158e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.68e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.398e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PKN2-204ENST00000436111 632 ntTSL 33.43□□□□□ -1.868e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 RAB11FIP3-204ENST00000449879 580 ntTSL 316.56■□□□□ 0.244e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.098e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.328e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.55e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.275e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.015e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 520.38■□□□□ 0.852e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.482e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 315.94■□□□□ 0.142e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 513.47□□□□□ -0.252e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 210.75□□□□□ -0.692e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.842e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 24.72□□□□□ -1.652e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)1.57□□□□□ -2.162e-12■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 RNF114-205ENST00000623732 569 ntTSL 524.12■■□□□ 1.459e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 RNF114-208ENST00000625177 580 ntTSL 323.76■■□□□ 1.399e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 19e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 RNF114-204ENST00000623528 624 ntTSL 319.73■□□□□ 0.759e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 RNF114-203ENST00000622999 2438 ntTSL 219.32■□□□□ 0.689e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.349e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 RNF114-207ENST00000624666 2006 ntTSL 210.15□□□□□ -0.789e-7■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.731e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 BCL3-207ENST00000474300 819 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 SLC13A3-209ENST00000468915 1597 ntTSL 514.52□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PHC3-201ENST00000465896 538 ntTSL 512.1□□□□□ -0.471e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 SLC13A3-211ENST00000495082 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.611e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.621e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 BCL3-206ENST00000473473 445 ntTSL 27.08□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.421e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.451e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PHC3-202ENST00000466189 580 ntTSL 35.55□□□□□ -1.521e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 ATAD2-206ENST00000530065 411 ntTSL 35.04□□□□□ -1.61e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PHC3-205ENST00000474275 2427 ntTSL 24.5□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PHC3-207ENST00000479467 987 ntTSL 24.34□□□□□ -1.711e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.781e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PHC3-204ENST00000472330 609 ntTSL 33.56□□□□□ -1.841e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PHC3-206ENST00000475729 772 ntTSL 53.33□□□□□ -1.881e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PHC3-210ENST00000484931 657 ntTSL 52.86□□□□□ -1.951e-6■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.954e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.734e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.724e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.474e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 MGAT4A-205ENST00000460768 426 ntTSL 217.87■□□□□ 0.454e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 FBXL19-203ENST00000427128 3312 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.024e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.024e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.134e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.244e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.244e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.274e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.274e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 DYNLRB1-204ENST00000480759 1053 ntTSL 310.56□□□□□ -0.724e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.854e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.054e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.154e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.184e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.24e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.344e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PWWP2A-203ENST00000520662 407 ntTSL 35.04□□□□□ -1.64e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 SPEN-203ENST00000442985 891 ntTSL 54.71□□□□□ -1.664e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 MGAT4A-207ENST00000484936 768 ntTSL 53.96□□□□□ -1.784e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.794e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 FBRS-204ENST00000482749 725 ntTSL 513.56□□□□□ -0.243e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 RBM39-244ENST00000615771 686 ntTSL 55.32□□□□□ -1.565e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.424e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.174e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.444e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.084e-9■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.054e-9■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 320.93■□□□□ 0.944e-9■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 USF2-215ENST00000602164 582 ntTSL 326.56■■□□□ 1.842e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 OXSR1-202ENST00000426620 1581 ntTSL 1 (best)23.48■■□□□ 1.352e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.242e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.182e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.152e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 USF2-210ENST00000598058 510 ntTSL 219.89■□□□□ 0.772e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.692e-8■□□□□ 11.3
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 119.8 ms