Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SCRN3Q0VDG4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCRN3Q0VDG4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms