Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms