Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms