Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms