Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK3Q00526 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms