Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2BQ00403 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms