Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3AP98173 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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