Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL23P62829 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL23P62829 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL23P62829 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL23P62829 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL23P62829 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPL23P62829 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RPL23P62829 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL23P62829 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL23P62829 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPL23P62829 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPL23P62829 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPL23P62829 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPL23P62829 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RPL23P62829 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms