Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC01547P58512 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms