Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms