Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms