Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK1EP49674 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms