Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYB561P49447 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYB561P49447 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYB561P49447 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYB561P49447 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYB561P49447 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYB561P49447 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYB561P49447 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYB561P49447 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms