Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCT3P49368 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCT3P49368 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCT3P49368 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms