Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4K2AP48426 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms