Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA3P34903 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms