Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMPK1P30085 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms