Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms