Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms