Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms