Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR3P25106 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms