Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GADD45AP24522 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms