Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRR1P24046 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms