Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNOP22674 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNOP22674 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNOP22674 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms