Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms