Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MUC1P15941 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MUC1P15941 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms