Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSP90AB1P08238 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSP90AB1P08238 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms