Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA3O96018 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA3O96018 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms