Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE8AO60658 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE8AO60658 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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