Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
URB1O60287 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
URB1O60287 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
URB1O60287 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
URB1O60287 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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