Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CREB3O43889 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms