Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCEO43556 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCEO43556 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCEO43556 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms