Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEF1E1O43324 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms