Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRXO43186 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CRXO43186 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRXO43186 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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