Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM2O43147 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM2O43147 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms